Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Tnnt3Q9QZ47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tnnt3Q9QZ47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tnnt3Q9QZ47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms