Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyth1Q9QX11 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyth1Q9QX11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyth1Q9QX11 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth1Q9QX11 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyth1Q9QX11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyth1Q9QX11 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms