Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kifc1Q9QWT9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kifc1Q9QWT9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kifc1Q9QWT9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kifc1Q9QWT9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms