Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc2lQ9JME7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc2lQ9JME7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc2lQ9JME7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc2lQ9JME7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc2lQ9JME7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms