Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc4apQ9JLV2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc4apQ9JLV2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc4apQ9JLV2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4apQ9JLV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc4apQ9JLV2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4apQ9JLV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms