Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bgrlQ9JJU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bgrlQ9JJU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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