Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJI8

Rpl38, 60S ribosomal protein L38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl38Q9JJI8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl38Q9JJI8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl38Q9JJI8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl38Q9JJI8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpl38Q9JJI8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl38Q9JJI8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl38Q9JJI8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms