Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnip1Q9JJ57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnip1Q9JJ57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcnip1Q9JJ57 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcnip1Q9JJ57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcnip1Q9JJ57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms