Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ11

Tacc3, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacc3Q9JJ11 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tacc3Q9JJ11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tacc3Q9JJ11 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tacc3Q9JJ11 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tacc3Q9JJ11 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tacc3Q9JJ11 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tacc3Q9JJ11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tacc3Q9JJ11 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tacc3Q9JJ11 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tacc3Q9JJ11 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms