Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LratQ9JI60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LratQ9JI60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LratQ9JI60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LratQ9JI60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LratQ9JI60 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LratQ9JI60 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LratQ9JI60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LratQ9JI60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LratQ9JI60 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LratQ9JI60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LratQ9JI60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms