Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Timp4Q9JHB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Timp4Q9JHB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Timp4Q9JHB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Timp4Q9JHB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Timp4Q9JHB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Timp4Q9JHB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Timp4Q9JHB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Timp4Q9JHB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms