Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Wdr61Q9ERF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr61Q9ERF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr61Q9ERF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr61Q9ERF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms