Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RhojQ9ER71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RhojQ9ER71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhojQ9ER71 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RhojQ9ER71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RhojQ9ER71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhojQ9ER71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms