Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SgshQ9EQ08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SgshQ9EQ08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SgshQ9EQ08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SgshQ9EQ08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SgshQ9EQ08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SgshQ9EQ08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms