Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv4Q9EPK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv4Q9EPK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv4Q9EPK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv4Q9EPK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv4Q9EPK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms