Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc97Q9DBT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc97Q9DBT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc97Q9DBT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms