Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn3Q9DAW9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnn3Q9DAW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnn3Q9DAW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnn3Q9DAW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnn3Q9DAW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms