Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smco2Q9DA21 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smco2Q9DA21 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smco2Q9DA21 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smco2Q9DA21 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smco2Q9DA21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms