Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc103Q9D9P2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc103Q9D9P2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc103Q9D9P2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc103Q9D9P2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc103Q9D9P2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc103Q9D9P2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc103Q9D9P2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms