Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg101Q9D8Z6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg101Q9D8Z6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg101Q9D8Z6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg101Q9D8Z6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms