Protein–RNA interactions for Protein: Q9D807

2200002J24Rik, RIKEN cDNA 2200002J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002J24RikQ9D807 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2200002J24RikQ9D807 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002J24RikQ9D807 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002J24RikQ9D807 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2200002J24RikQ9D807 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2200002J24RikQ9D807 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2200002J24RikQ9D807 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
2200002J24RikQ9D807 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms