Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Exosc8Q9D753 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Exosc8Q9D753 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Exosc8Q9D753 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Exosc8Q9D753 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms