Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc94Q9D6J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc94Q9D6J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc94Q9D6J3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms