Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasgef1cQ9D300 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rasgef1cQ9D300 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rasgef1cQ9D300 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1cQ9D300 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rasgef1cQ9D300 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rasgef1cQ9D300 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms