Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snu13Q9D0T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snu13Q9D0T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snu13Q9D0T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snu13Q9D0T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snu13Q9D0T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165 ms