Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srfbp1Q9CZ91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srfbp1Q9CZ91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srfbp1Q9CZ91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srfbp1Q9CZ91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srfbp1Q9CZ91 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Srfbp1Q9CZ91 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srfbp1Q9CZ91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srfbp1Q9CZ91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms