Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc8Q9CYA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zcchc8Q9CYA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc8Q9CYA6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.8 ms