Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins3Q9CY94 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gins3Q9CY94 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gins3Q9CY94 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins3Q9CY94 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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