Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx28Q9CWT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx28Q9CWT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx28Q9CWT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx28Q9CWT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms