Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot11Q9CWN7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot11Q9CWN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot11Q9CWN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot11Q9CWN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot11Q9CWN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms