Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma8Q9CWH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psma8Q9CWH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma8Q9CWH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psma8Q9CWH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psma8Q9CWH6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma8Q9CWH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms