Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc43Q9CR29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc43Q9CR29 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc43Q9CR29 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc43Q9CR29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc43Q9CR29 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms