Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otub2Q9CQX0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otub2Q9CQX0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otub2Q9CQX0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otub2Q9CQX0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otub2Q9CQX0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Otub2Q9CQX0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otub2Q9CQX0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otub2Q9CQX0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Otub2Q9CQX0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Otub2Q9CQX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms