Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim8Q9CQQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim8Q9CQQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim8Q9CQQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms