Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap4Q99P47 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap4Q99P47 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap4Q99P47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap4Q99P47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap4Q99P47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap4Q99P47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntnap4Q99P47 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms