Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NsmfQ99NF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NsmfQ99NF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NsmfQ99NF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NsmfQ99NF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NsmfQ99NF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NsmfQ99NF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms