Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajb11Q99KV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajb11Q99KV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnajb11Q99KV1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb11Q99KV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb11Q99KV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms