Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip2Q99JG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnip2Q99JG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip2Q99JG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip2Q99JG7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnip2Q99JG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms