Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek8Q91ZR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek8Q91ZR4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek8Q91ZR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek8Q91ZR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek8Q91ZR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek8Q91ZR4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms