Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6cQ91ZQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6cQ91ZQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde6cQ91ZQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde6cQ91ZQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde6cQ91ZQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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