Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atl3Q91YH5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atl3Q91YH5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atl3Q91YH5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atl3Q91YH5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atl3Q91YH5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atl3Q91YH5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atl3Q91YH5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms