Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcdha12Q91Y18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdha12Q91Y18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdha12Q91Y18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdha12Q91Y18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdha12Q91Y18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms