Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep57l1Q8VDS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep57l1Q8VDS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep57l1Q8VDS7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep57l1Q8VDS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep57l1Q8VDS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep57l1Q8VDS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cep57l1Q8VDS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cep57l1Q8VDS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep57l1Q8VDS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep57l1Q8VDS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms