Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf3Q8R3J4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mterf3Q8R3J4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mterf3Q8R3J4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mterf3Q8R3J4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms