Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacs1Q8K212 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs1Q8K212 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs1Q8K212 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs1Q8K212 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms