Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmem17Q8K0U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem17Q8K0U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms