Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc4a8Q8JZR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc4a8Q8JZR6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc4a8Q8JZR6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc4a8Q8JZR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc4a8Q8JZR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc4a8Q8JZR6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc4a8Q8JZR6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms