Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aph1bQ8C7N7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aph1bQ8C7N7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aph1bQ8C7N7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aph1bQ8C7N7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1bQ8C7N7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms