Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc90bQ8C3X2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc90bQ8C3X2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc90bQ8C3X2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms