Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx16Q8C080 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx16Q8C080 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx16Q8C080 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx16Q8C080 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms